Чтобы обеспечить нормальный и безопасный полет шаттла, потребуется не один мощный компьютер. Чтобы предотвратить возможные неисправности, принимая во внимание ошибки программирования, используются пять компьютеров, которые выполняют две разные программы. Две пары компьютеров работаю с программным обеспечением основного электронного оборудования. Они проверяют расчеты друг друга 440 раз в секунду и отбрасывают результаты, которые наиболее отличаются от остальных трех результатов. Пятый компьютер выполняет резервную программу и способен взять на себя управление в определенных условиях. Эта команда может быть отдана сами экипажем. Наиболее ответственные этапы полета, выведение на орбиту и спуск, требуют участия всех пяти компьютеров. Но при выполнении рутинных операций на орбите, которые не предполагают сложных заданий и вычислений, достаточно только двух или даже одного компьютера. Остальные в это время выключены или находятся в горячем резерве.
Каждый шаттл должен иметь эффективную систему теплозащиты. У орбитального корабля теплозащитное покрытие состоит из 24192 плиток и 3254 гибких матов изоляции. Это защищает от аэродинамического нагрева при выведении на орбиту и при спуске. В плитках сначала происходит процесс поглощения тепла, а потом постепенного его излучения. Покрытие сделано из нескольких материалов, у каждого из которых своя тепловая нагрузка (максимум — 1650° С), которую должен выдержать корабль при выведении и спуске. Самым теплостойким является серый композиционный углерод-графитовый материал. Он используется на носовой части и передней кромке крыльев. Черные плитки из стекловолокна используются там, где температура колеблется от 650 до 1260° С. Это передняя часть фюзеляжа, днище, передняя кромка вертикального стабилизатора. Белые плитки защищают заднюю часть носового отсека, хвостовую часть, боковые поверхности киля, где температура не превышает 650° С. Маты, сделанные из кварцевого волокна, и войлочные маты используются на участках корабля, которые подвержены значительному аэродинамическому нагреву при выведении на орбиту.
Обе системы дают необходимую защиту космонавтам и помогают сохранять в целости оборудование. Без них шаттл стал бы просто одноразовым, если бы смог вернуться на Землю в целости.